يتابع اتحاد الأطباء العرب باهتمام بالغ التطورات الخطيرة في فلسطين المحتلة والتى أسفرت عن استشهاد أكثر من ٥٠ فلسطينى وإصابة الآلاف ، وانطلاقا من واجبه القومى والأخلاقي والانساني فإن الاتحاد يؤكد على مايلي :
اولا :كون مدينة القدس بحسب النظام الأساسى لاتحاد الأطباء العرب هي مقره الدائم منذ تأسيسه عام 1962 فإنه يعلن رفضه الراسخ للاعتدء الأمريكي على مقدسات المسلمين والمسيحيين بنقل السفارة الأمريكية واستفزاز مشاعر اثنين مليار انسان بالاحتفال بهذا العدوان.
ويدعو الاتحاد الشعوب والحكومات والهيئات الإقليمية والدولية وعلى رأسها جامعة الدول العربية ومنظمة الأمم المتحدة وكذا منظمات المجتمع المدني وكل أحرار العالم للوقوف صفاً منيعاً ضد هذا العدوان الامريكي الداعم للكيان الصهيوني العنصري ( الذي أقرت الأمم المتحدة بعنصريته يوما ما بل صار أكثر عنصرية من نظام جنوب أفريقيا البائد ).
ما أدان الاتحاد على لسان الأمين العام أ.د/ أسامة رسلان القتل الجماعي من قبل قوات الكيان الصهيوني للمحتجين العزل على حدود قطاع غزة ويطالب بالحماية للشعب الفلسطيني من العدوان الاستعماري العنصري.